Instituto de Biociências de Botucatu
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     PESQUISA DE TESES E DISSERTAÇÕES :::

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ACESSE AS PÁGINAS COM OS RESULTADOS DA PESQUISA
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Autor :  ANDREIA AKEMI HOSHINO
Orientador :  MARCOS APARECIDO GIMENES
Programa :  Ciências Biológicas em Genética
Titulação :  Doutorado
Título :  ISOLAMENTO E CARACTERIZAÇÃO DE PROMOTORES TECIDO-ESPECÍFICOS A PARTIR DAS INFORMAÇÕES DO SUCEST (SUCARCANE EXPRESSED SEQUENCE TAGS)
Palavras-chave :  ISOLAMENTO; CARACTERIZAÇÃO
Defesa :  27/07/07
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Resumo :  --
 
Autor :  ANDREIA ALVES SOARES
Orientador :  CLAUDIO DE OLIVEIRA
Programa :  Ciências Biológicas em Zoologia
Titulação :  Doutorado
Título :  Estudos filogenéticos na superfamília Loricarioidea (Teleostei: Siluriformes) com base em seqüências do DNA nuclear e mitocondrial
Palavras-chave :  DNA MITOCONDRIAL; DNA NUCLEAR; FILOGENIA; GENÉTICA, LORICARIOIDEA; SILURIFORMES;
Defesa :  27/02/08
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Resumo :  A superfamília Loricarioidea, o maior grupo de Siluriformes da região Neotropical, é composta por seis famílias: Astroblepidae, Callichthyidae, Loricariidae, Nematogenyidae, Scoloplacidae e Trichomycteridae. Estudos morfológicos têm sugerido que as famílias Trichomycteridae e Nematogenyidae formam um grupo monofilético que é irmão do clado formado pelas demais famílias. As famílias Astroblepidae e Loricariidae formam um grupo monofilético que é irmão de Scoloplacidae, e essas três famílias formam um grupo monofilético que é irmão de Callichthyidae. Com o objetivo de testar as hipóteses de relacionamento descritas acima, foram seqüenciados segmentos dos genes mitocondriais 16S rRNA ribossômico (16S), citocromo oxidase I (COI) e citocromo b (cyt b) e os genes nucleares codificadores de proteínas recombination activating protein (rag1 e rag2), totalizando cinco genes de 48 espécies de Siluriformes, incluindo representantes de Diplomystidae, Nematogenyidae, Trichomycteridae, Callichthyidae, Scoloplacidae, Loricariidae e Astroblepidae. Ainda que as diferentes filogenias obtidas pelos métodos de máxima parcimônia não tenham sido todas congruentes, foi confirmada a monofilia de Loricarioidea, foi corroborado Nematogenyidae como grupo-irmão das demais famílias que constituem a superfamília Loricarioidea, bem como sua posição basal em relação aos demais Loricarioidea. Essas hipóteses haviam sido propostas em estudos morfológicos do grupo. Por outro lado, os dados moleculares sustentaram a existência de um clado formado pelas famílias Scoloplacidae e Callichthyidae que apareceram como grupo-irmão do clado formado pelas famílias Loricariidae, Trichomycteridae e Astroblepidae. Considerando as diferenças observadas entre as filogenias obtidas com dados morfológicos e moleculares conclui-se que uma ampliação dos dados (moleculares e morfológicos), será fundamental para um melhor entendimento das relações entre as famílias de Loricarioidea.
 
Autor :  ANDRÉIA BENEDITA POLETTO
Orientador :  CESAR MARTINS
Programa :  Ciências Biológicas em Genética
Titulação :  Doutorado
Título :  CITOGENÉTICA COMPARATIVA DE PEIXES DA FAMÍLIA CICHLIDAE
Palavras-chave :  CICLÍDEOS; CITOGENÉTICA; CROMOSSOMOS B; PEIXES
Defesa :  31/07/09
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Resumo :  ESTE TRABALHO TEVE POR OBJETIVO ANALISAR CITOGENETICAMENTE ESPÉCIES DA FAMÍLIA CICHLIDAE DE DIFERENTES ORIGENS. FORAM FEITAS ANÁLISES DE UMA ESPÉCIE ASIÁTICA, DE 22 AFRICANAS E 30 NEOTROPICAIS. O NÚMERO DIPLÓIDE NA FAMÍLIA VARIOU DE 2N=40 A 2N=60. OS SÍTIOS DE GENES DE RNAR 18S VARIARAM DE 2 A 9 CROMOSSOMOS PORTADORES, COM SÍTIOS TERMINAIS PARA OS AFRICANOS E EM APENAS UM GRANDE PAR CROMOSSÔMICO EM POSIÇÃO INTERSTICIAL OU TERMINAL PARA A MAIORIA DOS NEOTROPICAIS. A HIBRIDAÇÃO DO GENE RNAR 5S MARCOU SÍTIOS MÚLTIPLOS EM REGIÕES INTERSTICIAIS E CENTROMÉRICAS EM DUAS ESPÉCIES AFRICANAS, ENQUANTO QUE NOS CICLÍDEOS NEOTROPICAIS MARCOU DE UM A DOIS PARES, SEMPRE EM POSIÇÃO INTERSTICIAL. EM HAPLOCROMIS OBLIQUIDENS FORAM ENCONTRADOS UM A DOIS GRANDES CROMOSSOMOS METACÊNTRICOS SUPERNUMERÁRIOS E HETEROCROMÁTICOS EM 39,6% DA POPULAÇÃO, TANTO EM FÊMEA QUANTO EM MACHO. ESTE CROMOSSOMO B APRESENTOU SÍTIOS MÚLTIPLOS DE HIBRIDAÇÃO DE DNAR 18S E SINAIS LEVES NA REGIÃO CENTROMÉRICA DO DNA SATÉLITE CENTROMÉRICO SATA. SEQUÊNCIAS REPETITIVAS INSERIDAS EM BACS HIBRIDARAM DE FORMA DIFUSA POR TODA A EXTENSÃO DO ELEMENTO SUPERNUMERÁRIO. ESSE CROMOSSOMO B PODE TER SE ORIGINADO A PARTIR DE UM ISOCROMOSSOMO, OU POR ACÚMULO DE DNA REPETITIVO NUM PEQUENO PROTO-CROMOSSOMO B. EM METRIACLIMA LOMBARDOI UM GRANDE CROMOSSOMO B METACÊNTRICOE HETEROCROMÁTICO FOI DETECTADO EM 50% DAS FÊMEAS E EM NENHUM MACHO. ESTE ELEMENTO NÃO APRESENTOU SINAIS DE HIBRIDAÇÃO DE DNAR 18S, PORÉM DNAS REPETITIVOS INSERIDOS EM BACS HIBRIDARAM NOS BRAÇOS MENORES DO PRIMEIRO PAR DO COMPLEMENTO A, FORTEMENTE NA REGIÃO CENTROMÉRICA, E DE FORMA DIFUSA AO LONGO DO CROMOSSOMO B. HIPOTETIZAMOS QUE ESTE CROMOSSOMO B PODE TER SE ORIGINADO A PARTIR DE UM FRAGMENTO DO PRIMEIRO PAR DO COMPLEMENTO A, TENDO ACUMULADO DNAS REPETITIVOS COMO CONSEQUÊNCIA DA AUSÊNCIA DE RECOMBINAÇÃO. SUGERIMOS TAMBÉM QUE A ORIGEM DO CROMOSSOMO B A PARTIR DO PRIMEIRO PAR CROMOSSÔMICO PODERIA ESTAR LEVANDO OS SEUS PORTADORES A APRESENTAR AS CARACTERÍSTICAS ORGÂNICAS DE FÊMEAS, INDEPENDENTEMENTE DO SEXO GENÔMICO, POIS JÁ FORAM LOCALIZADOS ANTERIORMENTE GENES DE DETERMINAÇÃO SEXUAL NO PRIMEIRO GRANDE PAR DE CROMOSSOMOS DE TILÁPIAS, QUE POSSUI HOMOLOGIA COM O PRIMEIRO PAR DOS HAPLOCROMÍNEOS. PODE-SE CONCLUIR QUE OS PEIXES CICLÍDEOS APRESENTAM PADRÕES ESPECÍFICOS DE VARIAÇÃO ESTRUTURAL E NUMÉRICA NOS CROMOSSOMOS, PROVAVELMENTE DEVIDO À ATUAÇÃO DE DIFERENTES FORÇAS EVOLUTIVAS, EM FACE DE OCUPAREM DIFERENTES AMBIENTES E TEREM PASSADO POR DIFERENTES MODOS DE ESPECIAÇÃO. OS CROMOSSOMOS BS ENCONTRADOS NAS DUAS ESPÉCIES AFRICANAS PROVAVELMENTE SURGIRAM INDEPENDENTEMENTE NAS DUAS LINHAGENS, POIS APESAR DE AMBOS SEREM METACÊNTRICOS, POSSUEM DIFERENTES PADRÕES TANTO DE HERANÇA QUANTO DE HIBRIDAÇÃO DE SEQUÊNCIAS REPETITIVAS.
 
Autor :  ANDREIA SANTORO
Orientador :  CELSO LUIS MARINO
Programa :  Ciências Biológicas em Genética
Titulação :  Mestrado
Título :  IDENTIFICAÇÃO DE SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS (SNPS) NO GENE NOVE-CIS-EPOXICAROTENÓIDE DIOXIGENASE (NCED) EM EUCALYPTUS
Palavras-chave :  EUCALYPTUS, ÁCIDO ABSCÍSICO, SNPS, HAPLÓTIPOS, NCED.
Defesa :  17/12/10
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Resumo :  FLORESTAS DE EUCALIPTO NO BRASIL ESTÃO ENTRE OS ECOSSISTEMAS MAIS PRODUTIVOS DO MUNDO. A MADEIRA DO EUCALIPTO É PRINCIPALMENTE UTILIZADA PELAS EMPRESAS DE PAPEL E CELULOSE. CONTUDO, FATORES ABIÓTICOS E BIÓTICOS AFETAM A EXPANSÃO DESSAS FLORESTAS. A DISPONIBILIDADE DE ÁGUA É UMA DAS MAIORES LIMITAÇÕES PARA O DESENVOLVIMENTO DAS ESPÉCIES, AFETANDO A PRODUÇÃO DE BIOMASSA. O HORMÔNIO ÁCIDO ABSCÍSICO (ABA) DESENCADEIA RESPOSTAS DE RESISTÊNCIA A ESTRESSES ABIÓTICOS, EM PARTICULAR A SECA. O OBJETIVO DESTE TRABALHO FOI IDENTIFICAR SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS (SNPS) NO GENE NCED (NOVE-CIS-EPOXICAROTENÓIDE DIOXIGENASE), DA ROTA BIOSSINTÉTICA DO ÁCIDO ABSCÍSICO (ABA), EM EUCALYPTUS. ATRAVÉS DA UTILIZAÇÃO DA SEQUENCIA DE AMINOÁCIDO DA ENZIMA DE ARABIDOPSIS (ATNCED3) E DO BANCO DE DADOS DE EXPRESSED SEQUENCE TAGS (ESTS) DE EUCALYPTUS FOI POSSÍVEL O DESENVOLVIMENTO DE TRÊS OLIGONUCLEOTÍDEOS, OS QUAIS AMPLIFICARAM A REGIÃO DESEJADA DO GENE. ENTÃO, PRIMERS ESPECÍFICOS FORAM DESENHADOS E OS PRODUTOS DE AMPLIFICAÇÃO DE DIFERENTES INDIVÍDUOS SUBMETIDOS AO SEQUENCIAMENTO DIRETO. O ALINHAMENTO E AS ANÁLISES DAS SEQUENCIAS REVELARAM A OCORRÊNCIA DE SETE SNPS NO GENE NCED, EM UMA REGIÃO DE 1230 PARES DE BASES. A RAZÃO TRANSIÇÃO/TRANSVERSÃO FOI 1.33. APÓS A PREDIÇÃO DA PROTEÍNA, NO SITE SOFTBERRY E EXPASY, FORAM VERIFICADOS CINCO SNPS PRESENTES NA REGIÃO CODIFICADORA, OS QUAIS GERARAM MUTAÇÕES SINÔNIMAS. ATRAVÉS DO SOFTWARE DNASP, SETE HAPLÓTIPOS FORAM ENCONTRADOS NA AMOSTRA DE 65 INDIVÍDUOS GERANDO 15 GENÓTIPOS, DISTRIBUÍDOS ENTRE AS ESPÉCIES E. GRANDIS, E. UROPHYLLA E NO HÍBRIDO UROGRANDIS. PARA OS SETE SÍTIOS POLIMÓRFICOS FORAM DESENHADOS CONJUNTOS DE PRIMERS ESPECÍFICOS QUE PERMITIRÃO A GENOTIPAGEM EM LARGA ESCALA PARA ESTUDOS DE GENÉTICA DE POPULAÇÃO E EM PROGRAMAS DE MELHORAMENTO ASSISTIDO.
 
Autor :  ANDREO FERNANDO AGUIAR
Orientador :  MAELI DAL PAI SILVA
Programa :  Ciências Biológicas - Biologia Geral e Aplicada
Titulação :  Mestrado
Título :  EFEITOS DO TREINAMENTO RESISTIDO E DA SUPLEMENTAÇÃO DE CREATINA SOBRE A MORFOLOGIA E A EXPRESSÃO DA MIOSINA DE CADEIA PESADA (MHC) NO MÚSCULO ESTRIADO ESQUELÉTICO DE RATOS WISTAR
Palavras-chave :  TREINAMENTO; CREATINA
Defesa :  28/09/07
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Resumo :  7 Resumo Objetivo: Este estudo avaliou os possíveis efeitos do treinamento resistido e da suplementação de creatina sobre a morfologia e a expressão da miosina de cadeia pesada (MHC) no músculo estriado esquelético de ratos. Métodos: Ratos wistar machos (3 a 4 semanas, 80 a 100 g) foram divididos em quatro grupos: Não treinados sem a suplementação de creatina (Controle, CO; n= 8), Não treinados com a suplementação de creatina (Creatina, CR; n= 8), Treinados sem a suplementação de creatina (Exercício, EX; n= 8) e Treinados com a suplementação de creatina (Creatina + Exercício, CREX; n= 8). Os grupos EX e CREX foram submetidos a um protocolo de treinamento resistido de 30 dias, na qual foram realizadas sessões de saltos em uma cuba contendo água à 30ºC e 38 cm de profundidade, com intervalos de 40 segundos entre as séries. A sobrecarga de treinamento foi ajustada por meio de um colete acoplado na região torácica do animal, sendo equivalente a 50% do peso corporal, durante a fase de adaptação ao meio líquido (1º ao 5º dia), 60% nos dias subseqüentes (6º ao 25º), e 70% na fase final do treinamento físico (26º ao 30º). Os grupos CR e CREX foram suplementados com creatina (0,5 g/kg peso corporal) durante todo o período de treinamento físico, administrada via oral (gavage). Ao final do experimento, os animais foram pesados e sacrificados, o músculo sóleo foi retirado e os fragmentos musculares foram congelados em n-Hexano resfriado em nitrogênio líquido a -156°C. Cortes histológicos (10 μm) foram submetidos à reação da ATPase miofibrilar (mATPase) (pH 4,4), para a identificação dos tipos de fibras musculares (I, IC, IIC e IIA). Foi calculada a área de secção transversal (AST) dos tipos de fibras (200 fibras/ animal), utilizando-se um analisador de imagens Leica Qwin. A expressão da miosina de cadeia pesada (MHC) foi analisada através da técnica de eletroforese em gel de poliacrilamida (SDSPAGE). Resultados: Todos os grupos ganharam peso do início ao final do experimento, mas não houve diferença estatística entre eles. Os valores do consumo de ração diário de cada animal (CRA) e o consumo de ração total diário dos grupos (CRT) experimentais não foram estatisticamente diferentes entre os grupos. Não houve diferença significante na retenção hídrica intramuscular e na AST das fibras I, IC, IIC e IIA entre os grupos. O grupo CR apresentou um aumento significante no percentual da MHCI e redução no percentual da MHCII, comparado ao CO. O grupo EX aumentou o percentual de MHCII e reduziu a MHCI, em relação ao CO. Por outro lado, o grupo CREX não apresentou alterações no percentual de miosinas. Conclusão: A 8 suplementação de creatina associada ao treinamento resistido não afetou a proporção das isoformas de miosinas. Porém, a creatina isolada promoveu um efeito antagônico ao treinamento resistido na modulação das isoformas de MHCs. Para a creatina ser efetiva na hipertrofia muscular, precisa ser incorporada ao regime de treinamento, sendo dependente dos ajustes de sobrecarga (intensidade), nas sessões subseqüentes de treinamento.
 
Autor :  ANDREO FERNANDO AGUIAR
Orientador :  MAELI DAL PAI SILVA
Programa :  Ciências Biológicas - Biologia Geral e Aplicada
Titulação :  Doutorado
Título :  ADAPTAÇÕES MORFOFUNCIONAIS E RESPOSTAS MOLECULARES DO MÚSCULO ESQUELÉTICO DE RATOS SUBMETIDOS AO TREINAMENTO RESISTIDO
Palavras-chave :  ADAPTAÇÕES MORFOFUNCIONAIS; MÚSCULO ESQUELÉTICO; TREINAMENTO RESISTIDO
Defesa :  28/02/11
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Resumo :  EMBORA FORTES EVIDÊNCIAS DEMONSTREM QUE OS FATORES DE REGULAÇÃO MIOGÊNICA (MRFS) E O FATOR DE CRESCIMENTO SEMELHANTE À INSULINA (IGF-I) APRESENTEM UM IMPORTANTE PAPEL NA RESPOSTA HIPERTRÓFICA APÓS TREINAMENTO RESISTIDO (TR) AGUDO, PERMANECE DESCONHECIDO SE A RESPOSTA DOS MRFS E IGF-I TAMBÉM OCORRE DURANTE A ADAPTAÇÃO AO TR A LONGO-PRAZO. PORTANTO, O OBJETIVO DESTE ESTUDO FOI TESTAR A HIPÓTESE DE QUE A RESPOSTA HIPERTRÓFICA E MODULAÇÃO DAS FIBRAS DO MÚSCULO ESQUELÉTICO APÓS TR A LONGO-PRAZO PODERIA ESTAR ASSOCIADA AO AUMENTO NA EXPRESSÃO GÊNICA DOS MRFS E IGF-I. RATOS WISTAR (80 DIAS DE IDADE, 250-300 G) FORAM DIVIDIDOS EM QUATRO GRUPOS: CONTROLE 8 SEMANA (C8, N = 8), TREINADO 8 SEMANAS (T8, N = 8), CONTROLE 12 SEMANAS (C12, N = 8) E TREINADO 12 SEMANAS (T12, N = 8). OS GRUPOS T8 E T12 FORAM SUBMETIDOS A UM PROGRAMA DE TR PROGRESSIVO (3 DIAS/SEMANA) DURANTE 8 E 12 SEMANAS, RESPECTIVAMENTE. O PROTOCOLO DE TREINAMENTO CONSISTIU DE QUATRO SÉRIES DE 10-12 REPETIÇÕES, COM UM PERÍODO DE DESCANSO DE 40 SEGUNDOS ENTRE CADA SÉRIE, REALIZADO A 65-75% DE UMA REPETIÇÃO MÁXIMA (1RM). AO TÉRMINO DO EXPERIMENTO, OS ANIMAIS FORAM SACRIFICADOS E O MÚSCULO PLANTAR COLETADO PARA AS ANÁLISES MORFOLÓGICA E MOLECULAR. O TR DURANTE 8 E 12 SEMANAS NÃO PROMOVEU QUALQUER ALTERAÇÃO (P > 0,05) SIGNIFICANTE NO GANHO DE PESO CORPORAL E CONSUMO ALIMENTAR DOS GRUPOS T8 E T12 EM RELAÇÃO AOS GRUPOS C8 E C12, RESPECTIVAMENTE. APÓS 8 E 12 SEMANAS DE TR, A FORÇA ABSOLUTA (T8: 69,7% AND T12: 126,0%, P < 0,05) E RELATIVA (T8: 36,1% AND T12: 57,7%, P < 0,05) FOI SIGNIFICANTEMENTE ELEVADA NOS GRUPOS T8 E T12, EM COMPARAÇÃO AOS SEUS RESPECTIVOS CONTROLES. NO ENTANTO, HOUVE UM SIMILAR AUMENTO DA ÁREA DE SECÇÃO TRANSVERSAL (AST) DAS FIBRAS MUSCULARES (T8: 29% VS. T12: 35%, P > 0,05) ENTRE OS GRUPOS T8 E T12, COMPARADOS AOS GRUPOS C8 E C12, RESPECTIVAMENTE. ESTA ESTAGNAÇÃO HIPERTRÓFICA ENTRE 8 E 12 SEMANAS FOI CONSISTENTE COM O SIMILAR AUMENTO NA EXPRESSÃO DE MRNA PARA MIOGENINA (T8: 44,8% VS. T12: 37,7%, P > 0,05) E MYOD (T8: 22,9% VS. T12: 22,3%, P > 0,05) NOS GRUPOS T8 E T12. EM ADIÇÃO, A EXPRESSÃO GÊNICA DO IGF-I AUMENTOU 30,1% APÓS 8 SEMANAS DE TR (T8 X C8, P <0,05), MAS RETORNOU AOS NÍVEIS BASAIS APÓS 12 SEMANAS (T12 X C12, P > 0,05). A MODULAÇÃO DAS ISOFORMAS DE MHCIIX/D PARA MHCIIA E RECÍPROCA TRANSIÇÃO DAS FIBRAS IIX/IID PARA IIA FOI EVIDENTE SOMENTE APÓS 12 SEMANAS DE TR (T12 X C12, P < 0,05). OS DADOS DEMONSTRAM QUE A ESTAGNAÇÃO HIPERTRÓFICA OBSERVADA DURANTE O PROGRAMA DE TR A LONGO-PRAZO FOI ASSOCIADA A UM LIMITE MÁXIMO DE EXPRESSÃO GÊNICA DA MIOGENINA E MYOD, E RECIPROCAMENTE, COM O RETORNO DA EXPRESSÃO GÊNICA DO IGF-I PARA OS VALORES BASAIS. ALÉM DISSO, O AUMENTO DA EXPRESSÃO DE MIOGENINA, MYOD E IGF-I APÓS 8 SEMANAS DE TR NÃO FOI ASSOCIADA A ALTERAÇÕES NO CONTEÚDO DAS ISOFORMAS DE MHC E FREQÜÊNCIA DOS TIPOS DE FIBRAS. PORTANTO, OS RESULTADOS INDICAM UMA POSSÍVEL INTERAÇÃO ENTRE OS MRFS E IGF-I NO CONTROLE DA HIPERTROFIA MUSCULAR EM RESPOSTA AO TR A LONGO-PRAZO, SUGERINDO QUE ESSES FATORES ESTEJAM MAIS ENVOLVIDOS NO CONTROLE DA MASSA MUSCULAR DO QUE NA MODULAÇÃO DOS TIPOS DE FIBRAS.
 
Autor :  ANGÉLICA ROBATINO
Orientador :  PROF. DR. OSMAR CAVASSAN
Programa :  Ciências Biológicas em Botânica
Titulação :  Mestrado
Título :  ESTRUTURA DA COMUNIDADE DE TREPADEIRAS DE DOIS FRAGMENTOS DE FLORESTA ESTACIONAL SEMIDECIDUAL EM DIFERENTES ESTÁDIOS DE CONSERVAÇÃO
Palavras-chave :  ABUNDÂNCIA; DIVERSIDADE; FITOSSOCIOLOGIA; FRAGMENTAÇÃO FLORESTAL; LIANA.
Defesa :  29/04/10
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Resumo :  PLANTAS TREPADEIRAS SÃO COMPONENTES CARACTERÍSTICOS DAS FLORESTAS TROPICAIS E CONTRIBUEM SIGNIFICATIVAMENTE COM A DIVERSIDADE TAXONÔMICA. ALÉM DISSO, DESEMPENHAM PAPEL ESTRUTURAL E ECOLÓGICO ESSENCIAL PARA A MANUTENÇÃO DESSAS FLORESTAS. ÁREAS PERTURBADAS PODEM SER LOCAIS IDEAIS PARA A PROLIFERAÇÃO EXCESSIVA DE TREPADEIRAS, PREJUDICANDO OS PROCESSOS DE REGENERAÇÃO NATURAL. O OBJETIVO GERAL DESTE ESTUDO FOI A CARACTERIZAÇÃO FLORÍSTICA E ESTRUTURAL DE COMUNIDADES DE TREPADEIRAS INSERIDAS EM DOIS FRAGMENTOS DE FLORESTA ESTACIONAL SEMIDECIDUAL, SENDO UM COM INDICADORES DE PERTURBAÇÃO (MUNICÍPIO DE UNIÃO PAULISTA, SP) E O OUTRO CONSIDERADO CONSERVADO (MUNICÍPIO DE MATÃO, SP). POR MEIO DO MÉTODO DE PARCELAS, FORAM AMOSTRADOS 3278 INDIVÍDUOS TREPADORES. OS 1101 INDIVÍDUOS IDENTIFICADOS NO FRAGMENTO DE MATÃO FORAM DISTRIBUÍDOS EM 19 FAMÍLIAS, 43 GÊNEROS E 65 ESPÉCIES; AS FAMÍLIAS MAIS RICAS EM ESPÉCIES FORAM BIGNONIACEAE (17), SAPINDACEAE (10 ), MALPIGHIACEAE (9) E APOCYNACEAE (7). OS 1544 INDIVÍDUOS IDENTIFICADOS DO FRAGMENTO DE UNIÃO PAULISTA DISTRIBUÍRAM-SE EM 15 FAMÍLIAS, 38 GÊNEROS E 66 ESPÉCIES; AS FAMÍLIAS MAIS RICAS FORAM BIGNONIACEAE (25), MALPIGHIACEAE (10), FABACEAE (7), APOCYNACEAE (6) E SAPINDACEAE (6). EM MATÃO HOUVE MAIOR PROPORÇÃO DE TREPADEIRAS PREÊNSEIS (63,9%) EM RELAÇÃO A TREPADEIRAS VOLÚVEIS (27,9%) E ESCANDENTES (8,2%). JÁ EM UNIÃO PAULISTA FOI VERIFICADA PROPORÇÃO SIMILAR DE INDIVÍDUOS PREÊNSEIS (47,8%) E VOLÚVEIS (48,6%), COM MENOR PROPORÇÃO DE TREPADEIRAS ESCANDENTES (3,6%). A ESPÉCIE COM MAIOR IVI EM MATÃO FOI MELLOA QUADRIVALVIS, SENDO H’=3,11 NATS.IND-¹ E J’=0,75. EM UNIÃO PAULISTA, SERJANIA LETHALIS APRESENTOU MAIOR IVI, SENDO O H’= 3,09 NATS.IND-¹ E J’= 0,74. A SIMILARIDADE DE JACCARD FOI DE 36%, ENQUANTO QUE DE BRAY-CURTIS FOI DE 32%. AS CARACTERÍSTICAS CONSTATADAS PARA O FRAGMENTO DE MATÃO, COMO ABUNDÂNCIA TOTAL, EQUILÍBRIO PROPORCIONAL EM RELAÇÃO À ABUNDÂNCIA DE ÁRVORES, QUANTIDADE SIGNIFICATIVA DE INDIVÍDUOS COM DIÂMETRO >10CM, ALÉM DE MAIOR ÁREA BASAL TOTAL APESAR DE MENOR ABUNDÂNCIA, QUANDO COMPARADO AO FRAGMENTO PERTURBADO; CORROBORAM DADOS DA LITERATURA REFERENTES À FLORESTAS CONSERVADAS E EM ESTÁDIO AVANÇADO DE SUCESSÃO. DESSA FORMA, A PROPORÇÃO EXACERBADA DE TREPADEIRAS EM RELAÇÃO AO COMPONENTE ARBÓREO EVIDENCIADA NO FRAGMENTO DE UNIÃO PAULISTA, SOMADA À MAIOR ABUNDÂNCIA DE INDIVÍDUOS NAS MENORES CLASSES DIAMÉTRICAS, ALÉM DA PEQUENA QUANTIDADE DE INDIVÍDUOS >10 CM DE DIÂMETRO, SERIAM ESPERADAS PARA FRAGMENTOS COMO ESTE, PERTURBADO COM ESTÁDIO INICIAL A MÉDIO DE SUCESSÃO.
 
Autor :  ANGELO ALIANO FILHO
Orientador :  HELENICE DE OLIVEIRA FLORENTINO SILVA
Programa :  Biometria
Titulação :  Mestrado
Título :  METAHEURISTICAS EM UM PROBLEMA DE ROTACAO DE CULTURAS
Palavras-chave :  OTIMIZAC~AO, METAHEURSTICAS, ROTAC~AO DE CULTURAS
Defesa :  06/03/12
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Resumo :  UM DOS FOCOS CENTRAIS NA PRODUC~AO VEGETAL, DISCUTIDOS ULTIMAMENTE, E A UTILIZAC~AO DE MEDIDAS QUE VISAM UM PLANEJAMENTO SUSTENTAVEL E ECOLOGICO, TENDO EM VISTA A DEGRADAC~AO AMBIENTAL OCORRIDA NOS ULTIMOS ANOS. POR ESTE MOTIVO, A ROTAC~AO DE CULTURAS TEM GANHADO DESTAQUE NA LITERATURA, POIS E UM MEIO DE PRODUC~AO CUJOS PRINCPIOS PRATICOS VIABILIZAM UMA AGRICULTURA ECOLOGICA E PRODUTIVA. ESTA PRATICA, UMA VEZ BEM CONDUZIDA PELOS AGRICULTORES RURAIS, TRAZ INUMEROS BENEFCIOS, VISTO QUE O CONTROLE DE PRAGAS, PATOGENOS E DE PLANTAS DANINHAS E REALIZADO BIOLOGICAMENTE, DIMINUINDO A AC~AO DE PESTICIDAS PREJUDICIAIS AO MEIO AMBIENTE E MEDIDAS DE RECUPERAC~AO DO SOLO, TORNANDO-O SEMPRE FERTIL. NESTA DISSERTAC~AO, E APRESENTADO UM MODELO DE OTIMIZAC~AO 0-1 PARA O PROBLEMA DE ROTAC~AO DE CULTURAS, CUJO OBJETIVO FOI ENCONTRAR UMA PROGRAMAC~AO DE PLANTIO DE HORTALICAS QUE MAXIMIZE A LUCRO DA PRODUC~AO, LEVANDO-SE EM CONSIDERAC~AO RESTRIC~OES DE EPOCA DE SEMEADURA PARA CADA CULTURA CONSIDERADA, O N~AO CULTIVO DE PLANTAS DE MESMA FAMLIA EM LOTES VIZINHOS, PROIBIC~AO DE PLANTIO CONSECUTIVO DE PLANTAS DE MESMA FAMLIA BOT^ANICA EM UM MESMO LOTE, A NECESSIDADE DE ADUBAC~AO VERDE, PERODO DE DESCANSO DO SOLO E DE DEMANDA. NESTA MODELAGEM, FOI CONSIDERADA UMA AREA DE PLANTIO GENERICA, CUJOS LOTES S~AO IRREGULARMENTE DISTRIBUDOS E DE DIFERENTES TAMANHOS. PARA RESOLUC~AO DO PROBLEMA, FORAM DESENVOLVIDAS E IMPLEMENTADAS A SEGUINTES METAHEURSTICAS: (A) ALGORITMO GENETICO, (B) SIMULATED ANNEALING, E AS ABORDAGENS MISTAS (C) ALGORITMO GENETICO COM SIMULATED ANNEALING E (D) ALGORITMO GENETICO COM BUSCA LOCAL (MEMETICO). PARA AVALIAR OS COMPORTAMENTOS COMPUTACIONAIS DAS HEURSTICAS, CONSIDEROU-SE INST^ANCIAS DE DIFERENTES FORMAS COM VARIAC~OES NAS GEOMETRIAS E AREA DE PLANTIO. ADICIONALMENTE, UMA APLICAC~AO DESTES METODOS PARA UM CONJUNTO DE DADOS REAIS, TAMBEM FOI REALIZADA. OS RESULTADOS COMPUTACIONAIS ILUSTRARAM QUE OS ALGORITMOS, ESPECIALMENTE AS VERS~OES HBRIDAS, ENCONTRARAM SOLUC~OES FACTVEIS NUM REDUZIDO TEMPO COMPUTACIONAL, MOSTRANDO SEREM EXCELENTES FERRAMENTAS PARA AS TOMADAS DE DECIS~OES NESTA AREA
 
Autor :  ANGELO JOSÉ MAGRO
Orientador :  MARCOS ROBERTO DE MATTOS FONTES
Programa :  Ciências Biológicas em Genética
Titulação :  Doutorado
Título :  ESTUDOS ESTRUTURAIS EXPERIMENTAIS E TEÓRICOS COM PROTEÍNAS DO VENENO DA SERPENTE BOTHROPS JARARACUSSU
Palavras-chave :  BOTHROPS JARARACUSSU; CRISTALOGRAFIA DE PROTEÍNAS; DINÂMICA MOLECULAR; FOSFOLIPASE A2; METALOPROTEASE
Defesa :  22/11/06
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Resumo :  NESTE TRABALHO FORAM REALIZADOS ESTUDOS ESTRUTURAIS EXPERIMENTAIS E TEÓRICOS COM A BTHA-I E A BJUSSUMP-I, DUAS PROTEÍNAS ISOLADAS DO VENENO DE BOTHROPS JARARACUSSU. A PROTEÍNA BTHA-I É UMA FOSFOLIPASE A2 (PLA2) ÁCIDA COM ELEVADA ATIVIDADE CATALÍTICA E QUE POSSUI A CAPACIDADE DE INIBIR A AGREGAÇÃO DE PLAQUETAS E REDUZIR A PRESSÃO ARTERIAL. CRISTAIS DA BTHA-I NATIVA E DE SUA FORMA QUIMICAMENTE MODIFICADA PELO PBPB (BROMETO DE P-BROMOFENACILA), UM CONHECIDO INIBIDOR DE A PLA2S QUE TAMBÉM É CAPAZ DE SUPRIMIR OS MECANISMOS FARMACOLÓGICOS PRÓPRIOS DESTA PROTEÍNA, FORAM OBTIDOS E SUBMETIDOS A EXPERIMENTOS DE DIFRAÇÃO DE RAIOS-X. A ESTRUTURA CRISTALINA DA BTHA-I FOI ELUCIDADA A 1,9 Å DE RESOLUÇÃO E O PROCESSAMENTO DOS DADOS EXPERIMENTAIS REVELOU A PRESENÇA DE DOIS MONÔMEROS NA UNIDADE ASSIMÉTRICA. A ANÁLISE ESTRUTURAL DESTES MONÔMEROS REVELOU QUE A BTHA-I DIMÉRICA POSSUI UMA CONFORMAÇÃO OLIGOMÉRICA DISTINTA DAS DEMAIS PLA2S, ONDE OS SÍTIOS CATALÍTICOS DA MOLÉCULA ENCONTRAM-SE EXPOSTOS AO SOLVENTE. APESAR DAS CONDIÇÕES DE CRISTALIZAÇÃO DA BTHA-I NATIVA, É POSSÍVEL SUGERIR QUE A FORMA DIMÉRICA DESTA PROTEÍNA SEJA AQUELA ENCONTRADA PREDOMINANTEMENTE IN VIVO. A DETERMINAÇÃO ESTRUTURAL DA BTHA-I QUIMICAMENTE MODIFICADA PELO PBPB A 1,85 Å DE RESOLUÇÃO REVELOU A PRESENÇA INEQUÍVOCA DE MOLÉCULAS DE INIBIDOR COVALENTEMENTE LIGADAS AOS RESÍDUOS HIS48, LOCALIZADOS NOS SÍTIOS DE LIGAÇÃO DE SUBSTRATO DOS DOIS MONÔMEROS DO COMPLEXO. TRÊS REGIÕES DO COMPLEXO BTHA-I/PBPB SÃO ESTRUTURALMENTE ALTERADAS PELA LIGAÇÃO DO INIBIDOR: OS LOOPS DE LIGAÇÃO DE CA++ E AS REGIÕES DE Β-WING E C-TERMINAIS. ESTAS MUDANÇAS ESTRUTURAIS SÃO PROVAVELMENTE DERIVADAS DA CONFORMAÇÃO OLIGOMÉRICA APRESENTADA PELO COMPLEXO, CUJA DISPOSIÇÃO PODE EXPLICAR A SUPRESSÃO DAS ATIVIDADES FARMACOLÓGICAS DA BTHA-I OCASIONADAS PELA LIGAÇÃO DO PBPB. UM RESÍDUO PRESENTE NOS LOOPS “PANCREÁTICOS” DESTA PROTEÍNA (LYS69), APONTADO COMO UM DOS COMPONENTES NECESSÁRIOS À ATIVIDADE ANTICOAGULANTE MOSTRADA PELA BTHA-I, ENCONTRA-SE LOCALIZADO NA INTERFACE DIMÉRICA DO COMPLEXO BTHA-I/PBPB. ESTE FATO CORROBORA A HIPÓTESE QUE RELACIONA A CAPACIDADE DO PBPB DE SUPRIMIR ESTA E OUTRAS ATIVIDADES DA PROTEÍNA NATIVA À CONFORMAÇÃO OLIGOMÉRICA EXIBIDA PELA PROTEÍNA QUANDO QUIMICAMENTE MODIFICADA PELO INIBIDOR. O ESTUDO TEÓRICO DO DOMÍNIO CATALÍTICO DA BJUSSUMP-I, UMA METALOPROTEASES DE CLASSE PIII, FOI EXECUTADO COM BASE EM UM MODELO CRIADO A PARTIR DE TÉCNICAS DE THREADING E REFINADO POR MEIO DE UMA SIMULAÇÃO DE DINÂMICA MOLECULAR. ESTE MODELO FOI ENTÃO COMPARADO A OUTRAS SVMPS (SNAKE VENOM METALLOPROTEASES) E PROTEÍNAS DA FAMÍLIA DAS REPROLISINAS COM O INTUITO DE IDENTIFICAR EVENTUAIS DIFERENÇAS ESTRUTURAIS, AS QUAIS PODEM SER ÚTEIS PARA O ENTENDIMENTO PLENO DAS ATIVIDADES BIOQUÍMICAS DESTAS ENZIMAS. A PRESENÇA DE GRANDES PORÇÕES HIDROFÓBICAS E ALGUNS RESÍDUOS ELETRICAMENTE CARREGADOS CONSERVADOS NAS SUPERFÍCIES DAS SVMPS E DE OUTRAS METALOPROTEASES FOI UM INTERESSANTE ACHADO RESULTANTE DESTA COMPARAÇÃO. DE FORMA ADICIONAL, UMA ANÁLISE FILOGENÉTICA DO DOMÍNIO CATALÍTICO DA BJUSSUMP-I FOI REALIZADA DE MODO A PROVER NOVAS INFORMAÇÕES A RESPEITO DA EVOLUÇÃO MOLECULAR DESTA E DE OUTRAS MOLÉCULAS PERTENCENTES A ESTA MESMA FAMÍLIA DE PROTEÍNAS
 
Autor :  ANTHONY CESAR DE SOUZA CASTILHO
Orientador :  JOSÉ BURATINI JUNIOR
Programa :  Ciências Biológicas em Farmacologia
Titulação :  Mestrado
Título :  EXPRESSÃO DO FATOR DE CRESCIMENTO FIBROBLÁSTICO 10 (FGF-10) EM FOLÍCULOS PRÉ-ANTRAIS E ANTRAIS JOVENS DURANTE O DESENVOLVIMENTO OVARIANO EM FETOS BOVINOS
Palavras-chave :  FATOR DE CRESCIMENTO; FGF-10 E BOVINOS; FOLICULOGÊNESE; FOLÍCULOS PRÉ-ANTRAIS,
Defesa :  24/04/08
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Resumo :  O desenvolvimento folicular pré-antral é controlado predominantemente por peptídeos intraovarianos, incluindo os FGFs. O FGF-10 participa de interações parácrinas entre células mesenquimais e epiteliais, regulando a proliferação e diferenciação celular e também tem sido detectado em folículos pré-antrais. No entanto, a expressão do FGF- 10 durante o desenvolvimento ovariano fetal e a possível associação com a dinâmica folicular ainda não haviam sido investigados. O objetivo do presente estudo foi investigar o padrão da expressão do FGF-10 durante o desenvolvimento ovariano fetal ao longo da gestação. Trinta fetos bovinos (predominantemente Bos indicus) foram obtidos em matadouro e divididos em seis grupos (n=5) de acordo com a idade gestacional, estimada pelo comprimento entre o topo da cabeça e o início da cauda (grupos: 60, 75, 90, 120, 150 e 210 dias de gestação). Um ovário de cada feto foi destinado à análise histológica da população folicular e imunohistoquímica e o outro submetido à extração de RNA total. A expressão gênica do FGF-10 foi investigada por RT-PCR em tempo real utilizando oligonucleotídeos iniciadores bovino-específico. Os valores da expressão foram calculados usando ciclofilina A como controle interno. A imunohistoquímica foi realizada utilizando anticorpo policlonal anti-FGF-10 humano produzido em coelho. A análise histológica revelou presença somente de cordões ovígeros aos 60 dias, aparecimento de folículos primordiais aos 75 dias, presença de folículos primários aos 90 dias, e aumento da população de folículos primários aos 120 dias. Além disso, aparecimento de folículos secundários aos 150 e de folículos antrais Anthony César de Souza Castilho – Mestrado- Farmacologia 19 jovens aos 210 dias de gestação. A expressão gênica do FGF-10 foi maior aos 210 dias quando comparados com aos 60, 75 e 90. A proteína FGF-10 foi detectada em células germinativas primordiais, oócitos e células da granulosa de todos os tipos foliculares presente; bem como em células da teca de folículos secundários e antrais jovens. O aumento da expressão gênica do FGF-10 foi temporalmente associado ao aparecimento de folículos antrais jovens exibindo uma camada da teca mais desenvolvida aos 210 dias de gestação. Em conclusão, a expressão de FGF-10 está presente ao longo do desenvolvimento ovariano fetal em todas as classes foliculares e aumentada no fim da gestação, sugerindo sua participação no controle da foliculogênese em pré-antral e, particularmente, da foliculogênese antral em bovinos. Palavras chaves: FGF-10, ovário fetal, folículos, expressão gênica, bovinos.
 
Autor :  ANTHONY CÉSAR DE SOUZA CASTILHO
Orientador :  JOSÉ BURATINI JÚNIOR
Programa :  Ciências Biológicas em Farmacologia
Titulação :  Doutorado
Título :  EXPRESSÃO DOS MEMBROS DA SUBFAMÍLIA DO FATOR DE CRESCIMENTO FIBROBLÁSTICO 7 (FGF7) E SEUS RECEPTORES EM FOLÍCULOS ANTRAIS BOVINOS
Palavras-chave :  FGF22, FGFR1B, FOLÍCULOS ANTRAL, BOVINO
Defesa :  22/03/11
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Resumo :  O FGF3, FGF7, FGF10 E FGF22 SÃO MEMBROS DA SUBFAMÍLIA DO FGF7 E ATUA VIA FGFR2B E FGFR1B. EM FOLÍCULOS ANTRAIS BOVINOS, O FGF10 FOI DETECTADO EM OÓCITOS E CÉLULAS DA TECA, OS NÍVEIS DE MRNA FORAM NEGATIVAMENTE CORRELACIONADAS COM AS CONCENTRAÇÕES INTRAFOLICULARES DE ESTRADIOL. O FGF7 TAMBÉM FOI EXPRESSO NAS CÉLULAS DA TECA E ASSIM COMO O FGF10, INIBIU A PRODUÇÃO DE ESTRADIOL EM CÉLULAS DA GRANULOSA (CG). O PRIMEIRO OBJETIVO DO PRESENTE TRABALHO FOI DETERMINAR OS PADRÕES ESPACIAIS E TEMPORAIS DA EXPRESSÃO DO FGF22 E DO FGFR1B EM ANTRAIS BOVINOS. COMO A EXPRESSÃO DO FGFR1B FOI ALTERADA PELO STATUS NAS CÉLULAS DA GRANULOSA, NÓS DECIDIMOS ENTÃO USAR O SISTEMA DE CULTIVO PARA ACESSAR A REGULAÇÃO DA EXPRESSÃO GÊNICA PELO FSH E IGF-1, FOLÍCULOS ANTRAIS MAIORES DO QUE 5MM DE DIÂMETRO FORAM DISSECADOS DE OVÁRIOS BOVINOS PROVENIENTES DE ABATEDOURO, CG E CÉLULAS DA TECA (CT) FORAM SEPARADAS E O RNA TOTAL EXTRAÍDO. AS CONCENTRAÇÕES DE ESTRADIOL E PROGESTERONA NO FLUIDO FOLICULAR FORAM MENSURADAS POR RIE E OS FOLÍCULOS FORAM AGRUPADOS DE ACORDO COM A RAZÃO E2:P4 DE <0,01 (ATRÉSICOS, N=15), 0,01-1 (TRANSICIONAL, N=15) E >1 (SAUDÁVEL, N=15). COMPLEXOS CUMULUS-OÓCITO (COCS) FORAM ASPIRADOS DE FOLÍCULOS MORFOLOGICAMENTE SAUVÁVEIS E AGRUPADOS PELO DIÂMETRO FOLICULAR (1-3; 3,1-6; 6,1-8 E >8MM, N=4), OS OÓCITOS E CÉLULAS DO CUMULUS FORAM SEPARADOS E O RNA TOTAL EXTRAÍDO DE CADA TIPO CELULAR DE 20 COCS. PARA TESTAR OS EFEITOS DO FSH E DO IGF-1 SOBRE A EXPRESSÃO DO MRNA DO FGFR1B, CÉLULAS DA GRANULOSA DE FOLÍCULOS PEQUENOS (2-5MM) FORAM CULTIVADAS EM MEIO LIVRE DE SORO COM FSH (0; 0,05; 0,1; 0,5 E 1NG/ML) OU ANÁLOGO DE IGF-1 (O; 5; 10; 50 E 100 NG/ML). A EXPRESSÃO DO MRNA DO FGF22 E DO FGFR1B FOI ACESSADA POR RT-PCR EM TEMPO REAL USANDO OLIGONUCLEOTÍDEOS INICIADORES BOVINOESPECÍFICO E O GAPDH, CICLOFILINA E HISTONA H2A COMO CONTROLES ENDÓGENOS. A PRESENÇA DAS PROTEÍNAS FGF22 E FGFR1 FOI ACESSADA POR IMUNOHISTOQUÍMICA. O MRNA DO FGFR1B FOI DETECTADO EM CT, CG, CÉLULAS DO CUMULUS, MAS NÃO EM OÓCITOS. O MRNA DO FGF22 FOI DETECTADO EM CT, CÉLULAS DO CUMULUS, INCONSISTENTE EM CG, E AUSENTE EM OÓCITO. AS PROTEÍNAS FGF22 E FGFR1 FORAM DETECTADAS EM CT E CG. PARA AMBOS GENES, A ABUNDÂNCIA DE MRNA FOI MAIOR EM CT DE FOLÍCULOS TRANSICIONAIS QUANDO COMPARADOS COM FOLÍCULOS SAUDÁVEIS (P<0,05) E NÃO VARIOU COM O TAMANHO DO FOLÍCULO NAS CÉLULAS DO CUMULUS. NAS CG, O IGF-1 INIBIU A EXPRESSÃO DO MRNA DO FGFR1B (P<0,05). A EXPRESSÃO INTENSIFICADA EM FOLÍCULOS TRANSICIONAIS SUGERE UM PAPEL PARA O FGF22 NO CONTROLE DA ATRESIA FOLICULAR. A ATENUAÇÃO DA INFLUÊNCIA DO FGF22 EM FOLÍCULOS SAUDÁVEIS VIA INIBIÇÃO DOS RECEPTORES DE FGFS PARECE SER UMA IMPORTANTE AÇÃO PRÓ-SOBREVIVÊNCIA DO IGF-1.
 
Autor :  ANTONIO LEÃO CASTILHO
Orientador :  ADILSON FRANSOZO
Programa :  Ciências Biológicas em Zoologia
Titulação :  Doutorado
Título :  REPRODUÇÃO E RECRUTAMENTO DOS CAMARÕES PENAEOIDEA (DECAPODA:DENDROBRANCHIATA) NO LITORAL NORTE DO ESTADO DE SÃO PAULO
Palavras-chave :  REPRODUÇÃO; RECRUTAMENTO; MATURIDADE; PENAEOIDEA; XIPHOPENAEUS KOYERI.
Defesa :  30/01/08
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Resumo :  Xiphopenaeus kroyeri representa 90% dos camarões capturados em Ubatuba. O presente estudo investigou a reprodução e recrutamento de X. kroyeri no litoral norte do estado de São Paulo. As coletas foram realizadas mensalmente (janeiro/1998 a junho/2003) com barco camaroneiro (redes “double rig”), nas profundidades de 5-45m. Totais de 27075 machos e 31497 fêmeas foram capturados. As fêmeas apresentaram comprimento da carapaça (CC) médio de 16,2mm. Tamanhos inferiores que 13mm foram juvenis em mais de 90%, declinando para 61% com 13mm e ausentes com 14mm. O recrutamento juvenil e a desova foram contínuos. Porcentagens de fêmeas maduras se correlacionaram positivamente com a temperatura da água e negativamente com a porcentagem de recrutas (Spearman, p<0,05). O 1º pico de desova foi observado em fevereiro-março (verão) com recrutamento de maio-agosto, e um 2º em setembro-dezembro (inverno-primavera) com pico de recruta em novembro-fevereiro, demonstrando uma provável desova efetiva, pela atividade de desova contribuir com um sucessivo recrutamento. As maiores porcentagens de fêmeas maduras na primavera-verão (máximo de 90%) estariam relacionadas ao regime anual da Água Central do Atlântico Sul no mesmo período. Tal massa de água proporciona um aumento na produção primária marinha (plâncton), sugerindo que a disponibilidade de alimento para as larvas (prole) possa ser um importante fator na desova de X. kroyeri. O período atual de fechamento da pesca do camarão sete-barbas ocorre durante outubrodezembro, protegendo apenas o recrutamento de dezembro, conforme os picos encontrados no presente estudo. Caso não se estabeleça um defeso embasado em conhecimentos científicos, logo o estoque de X. kroyeri entrará colapso.
 
Autor :  ARIANE CRISTINA MENDES DE OLIVEIRA BRUDER NASCIMENTO
Orientador :  PROF. DR. EDUARDO BAGAGLI
Programa :  Ciências Biológicas - Biologia Geral e Aplicada
Titulação :  Mestrado
Título :  SUSCEPTIBILIDADE ANTIFÚNGICA, PRODUÇÃO DE BIOFILME E CARACTERIZAÇÃO DO GENE ALS3 EM ISOLADOS DE CANDIDA ALBICANS E NÃO-ALBICANS DO HOSPITAL DAS CLÍNICAS, UNESP, BOTUCATU
Palavras-chave :  ALS3; CANDIDA ALBICANS; CANDIDA PARAPSILOSIS; BIOFILME; SUSCEPTIBILIDADE ANTIFÚNGICA
Defesa :  19/02/09
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Resumo :  LEVEDURAS OPORTUNISTAS DO GÊNERO CANDIDA SÃO CAPAZES DE DISSEMINAR-SE EM HOSPEDEIROS SUSCEPTÍVEIS, NUM PROCESSO CRESCENTE NOS ÚLTIMOS ANOS. UM FATOR COMPLICADOR DESTES QUADROS OCORRE QUANDO ESTAS LEVEDURAS SÃO CAPAZES DE PRODUZIR BIOFILME, PRINCIPALMENTE QUANDO ASSOCIADAS A CATETERES OU OUTROS DISPOSITIVOS MÉDICOS, ELEVANDO O PODER DE PENETRAÇÃO E INVASÃO EM ÓRGÃOS DO HOSPEDEIRO. POR TAMBÉM CONFERIR MAIOR RESISTÊNCIA ÀS DROGAS ANTIFÚNGICAS DO QUE AS CÉLULAS DISPERSAS, O BIOFILME FÚNGICO TORNOU-SE UM DOS MAIORES PROBLEMAS NO COMBATE A ESTAS INFECÇÕES. A BASE GENÉTICA DA PRODUÇÃO DE BIOFIMES NESTAS LEVEDURAS É COMPLEXA, PORÉM JÁ FOI DETERMINADO O ENVOLVIMENTO DE GENES DA FAMÍLIA ALS, CODIFICADORES DE GLICOPROTEÍNAS DE ADESÃO. DENTRE OS OITO GENES DESTA FAMÍLIA (ALS1 AO ALS7 E ALS9), DESTACA-SE O PAPEL DE ALS3. O GENE ALS3, ASSIM COMO TODOS OS OUTROS GENES DA FAMÍLIA, APRESENTA UMA ESTRUTURA COMPOSTA POR 3 DOMÍNIOS. O DOMÍNIO 5’, REGIÃO BEM CONSERVADA; UM DOMÍNIO CENTRAL QUE APRESENTA MOTIFS DE 108PB REPETIDOS EM TANDEM, COM VARIAÇÕES DE TAMANHO ENTRE OS GENES DA MESMA FAMÍLIA E ENTRE O MESMO GENE EM DIFERENTES ESPÉCIES, EM UMA MESMA ESPÉCIE E ATÉ MESMO ENTRE ALELOS DE UMA MESMA CEPA, E O DOMÍNIO 3, MENOS CONSERVADO QUE O DOMÍNIO 5’, QUE PODE APRESENTAR VARIAÇÕES DE TAMANHO E DE ALGUMAS SEQÜÊNCIAS DE AMINOÁCIDOS. TENDO EM VISTA A CRESCENTE INCIDÊNCIA DE INFECÇÕES POR ESSE MICRORGANISMO EM TODO O MUNDO, O PRESENTE ESTUDO OBJETIVOU INVESTIGAR A FREQÜÊNCIA DAS DIFERENTES ESPÉCIES DE CANDIDA EM NOSSA REGIÃO E CARACTERIZÁ-LAS QUANTO À SUSCEPTIBILIDADE A DROGAS ANTIFÚNGICAS E PRODUÇÃO DE BIOFILME, E POSSÍVEL CORRELAÇÃO DA PRODUÇÃO DE BIOFILME COM POLIMORFISMOS DE TAMANHO DO GENE ALS3. OS RESULTADOS OBTIDOS CONFIRMAM A CRESCENTE INCIDÊNCIA DE ESPÉCIES NÃO-ALBICANS, PRINCIPALMENTE ISOLADAS DE INFECÇÕES INVASIVAS COMO CULTURA DE SANGUE E LIQUIDO PERITONEAL, ONDE C. PARAPSILOSIS FOI A ESPÉCIE MAIS FREQÜENTE ISOLADA. EM RELAÇÃO À PRODUÇÃO DE BIOFILME, TAMBÉM OS ISOLADOS DE INFECÇÕES INVASIVAS APRESENTARAM MAIOR POSITIVIDADE PARA A PRODUÇÃO DE BIOFILME QUE OS DE SECREÇÃO VAGINAL E URINA. QUANTO ÀS ESPÉCIES, AMOSTRAS DE CANDIDA NÃO-ALBICANS TAMBÉM APRESENTARAM MAIOR POSITIVIDADE PARA A PRODUÇÃO DE BIOFILME QUE AS DE C. ALBICANS. REAÇÕES DA POLIMERASE EM CADEIA FORAM REALIZADAS PARA O GENE ALS3, POLIMORFISMOS DE TAMANHO FORAM DETECTADOS, MAS A CORRELAÇÃO DO PADRÃO DE POLIMORFISMOS COM A PRODUÇÃO, IN-VITRO, DE BIOFILME NÃO FOI SIGNIFICATIVA. O PRESENTE ESTUDO TAMBÉM APRESENTA DADOS DE SUSCEPTIBILIDADE A QUATRO DROGAS ANTIFÚNGICAS, FLUCONAZOL, CETOCONAZOL, ITRACONAZOL E ANFOTERICINA B, ONDE TODAS APRESENTARAM EXCELENTE ATIVIDADE SOBRE AS CEPAS TESTADAS E RESISTÊNCIA FOI DETECTADA EM POUCOS ISOLADOS. OS DADOS OBTIDOS NO PRESENTE TRABALHO PODEM REFLETIR A SITUAÇÃO DAS INFECÇÕES POR CANDIDA SPP. EM NOSSA REGIÃO, BEM COMO ORIENTAR NO TRATAMENTO E PREVENÇÃO DE INFECÇÕES.
 
Autor :  ARIANE LEITE ROZZA
Orientador :  PROFA. DRA. CLÁUDIA HELENA PELLIZZON
Programa :  Ciências Biológicas em Farmacologia
Titulação :  Mestrado
Título :  ATIVIDADE GASTROPROTETORA DO ÓLEO ESSENCIAL DE CITRUS LEMON (RUTACEAE), DE SEUS COMPONENTES PRINCIPAIS LIMONENO E Β-PINENO E DO ÓLEO ESSENCIAL DE CROTON CAJUCARA (EUPHORBIACEAE).
Palavras-chave :  CITRUS LEMON; LIMONENO; Β-PINENO; CROTON CAJUCARA; ÚLCERAS GÁSTRICAS
Defesa :  30/04/09
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Resumo :  O PRESENTE TRABALHO TEVE COMO OBJETIVOS TESTAR A ATIVIDADE GASTROPROTETORA DE ÚLCERAS GÁSTRICAS E MECANISMOS DE AÇÃO DO ÓLEO ESSENCIAL DE CROTON CAJUCARA (CC), DO ÓLEO ESSENCIAL DE CITRUS LEMON (CL) E DOS CONSTITUINTES MAJORITÁRIOS DE CL, QUE SÃO O LIMONENO (L) E O Β- PINENO (P). ASSIM, FORAM REALIZADOS MODELOS DE INDUÇÃO DE ÚLCERA GÁSTRICA POR ETANOL ABSOLUTO PARA CL, L, P E CC E POR DROGA ANTI-INFLAMATÓRIA NÃO ESTEROIDAL (INDOMETACINA) PARA CL, L E P. TODOS OS RESULTADOS FORAM EXPRESSOS EM MÉDIA  EPM (P<0.05). NO MODELO DE INDUÇÃO DE ÚLCERAS POR ETANOL ABSOLUTO, A ÁREA DAS LESÕES (MM2) FOI 0.00  0.00** PARA CL, L E CC (100% DE GASTROPROTEÇÃO), 73.20  27.32 PARA P, QUE NÃO EXERCEU EFETIVA GASTROPROTEÇÃO (53.26%), 22.27  8.21** PARA O CONTROLE POSITIVO (85.80%) E 156.60  36.30 PARA O VEÍCULO. O ESCORE MICROSCÓPICO INDICOU EXCELENTE PRESERVAÇÃO DA MUCOSA POR CL**, L*** E CC***. A ÁREA DE MARCAÇÃO IMUNOISTOQUÍMICA PARA HEAT SHOCK PROTEIN 70 FOI ESTATISTICAMENTE MAIOR NOS GRUPOS CL, L, P E CC E PARA PEPTÍDEO INTESTINAL VASOATIVO FOI MAIOR NOS GRUPOS CL, L E P. OS NÍVEIS DE GLUTATIONA (GSH, EM ΜG/ML) FORAM 1182.00  52.47** PARA CL, 1316.6  67.75** PARA L, 1286.5  93.15* PARA CC, 1195.60  37.57** PARA O CONTROLE POSITIVO, 982.8  79.07** PARA O VEÍCULO E 1704.30 ± 149.03 PARA O GRUPO BRANCO. NA INDUÇÃO DE ÚLCERA POR INDOMETACINA, CL EXERCEU GASTROPROTEÇÃO DE 98.3% COM ÁREA DE LESÃO (MM2) 0.85 ± 0.85**, L EXERCEU GASTROPROTEÇÃO DE 50.1% (ÁREA LESADA 24.34 ± 5.3**), P NÃO EXERCEU EFETIVO EFEITO GASTROPROTETOR (37%) COM ÁREA LESADA 30.66 ± 4.22, CONTRA 66.6% DE GASTROPROTEÇÃO E 16.27 ± 4.49** PARA O CONTROLE POSITIVO E 48.72 ± 6.64 DE ÁREA LESADA PARA O VEÍCULO. CL ADMINISTRADO ISOLADAMENTE MANTEVE OS NÍVEIS GÁSTRICOS DE PGE2 (EM NG/ML) EM 18,25 ± 2,58, MESMO COM A ADMINISTRAÇÃO EM CONJUNTO COM INDOMETACINA (DROGA QUE INIBE A SÍNTESE DE PGE2) (17.89 ± 1.55), CONTRA 14.56 ± 1.58 PARA O VEÍCULO E 7.00 ± 1.31** PARA O VEÍCULO + INDOMETACINA E 21.14 ± 1.14 PARA O BRANCO. JÁ L MANTEVE ELEVADOS OS NÍVEIS DE PGE2 (16.54 ± 1.77), MAS NÃO QUANDO ADMINISTRADO EM CONJUNTO COM INDOMETACINA (10.21 ± 2.17**). O EFEITO GASTROPROTETOR DE CC É DEPENDENTE DOS COMPOSTOS SULFIDRÍLICOS (SH), MAS NÃO DO ÓXIDO NÍTRICO (NO). CL E CC APRESENTARAM CONCENTRAÇÃO INIBITÓRIA MÍNIMA DE 125 ΜG/ML E L DE 75 ΜG/ML PARA A BACTÉRIA HELICOBACTER PYLORI. CL E L TÊM EFICÁCIAS SEMELHANTES NA GASTROPROTEÇÃO CONTRA ÚLCERAS INDUZIDAS POR ETANOL E INDOMETACINA, ENTÃO L CONTIDO NO ÓLEO ESSENCIAL CL É O RESPONSÁVEL ISOLADO PELO EFEITO GASTROPROTETOR QUE CL EXERCE. O MECANISMO DE AÇÃO GASTROPROTETOR DE CL E L ENVOLVE ATIVAÇÃO DE HSP-70 E VIP E MANUTENÇÃO DE PGE2, MAS NÃO ESTÁ ENVOLVIDO COM A GLUTATIONA. CC TEM EXCELENTE ATIVIDADE GASTROPROTETORA CONTRA ETANOL E INDOMETACINA, ATIVANDO HSP-70 E SH MAS NÃO NO, VIP NEM GLUTATIONA.
 
Autor :  ARMANDO CESAR RODRIGUES CASIMIRO
Orientador :  MARCOS GOMES NOGUEIRA
Programa :  Ciências Biológicas em Zoologia
Titulação :  Mestrado
Título :  AVALIAÇÃO TEMPORAL E ESPACIAL DO PROCESSO DE INTRODUÇÃO DA ESPÉCIE CICHLA KELBERI (KULLANDER & FERREIRA, 2006) NO RESERVATÓRIO DE UHE ESCOLA MACKENZIE (CAPIVARA) RIO PARANAPANEMA
Palavras-chave :  CICHLA MONOCULUS, ESPÉCIE ESTABELECIDA, INVASÃO BIOLÓGICA, REPRESA DE CAPIVARA
Defesa :  28/07/11
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Resumo :  O RESERVATÓRIO DA UHE ESCOLA MACKENZIE (REPRESA DE CAPIVARA) RIO PARANAPANEMA FOI CONSTITUÍDO EM 1977 E REPRESENTA O MAIOR RESERVATÓRIO EM EXTENSÃO E VOLUME OCUPADO NA BACIA HIDROGRÁFICA DO RIO PARANAPANEMA E NAS PRIMEIRAS DÉCADAS (80 E 90) APÓS SUA FORMAÇÃO FOI PALCO DE CONSTANTES INTRODUÇÕES ACIDENTAIS E INTENCIONAIS DOS MAIS DIVERSOS ORGANISMOS, SENDO UMA DESTAS ESPÉCIES A CICHLA MONOCULUS. NESTE CONTEXTO, DIVERSOS PESQUISADORES CONCLUÍRAM QUE ESPÉCIES DO GÊNERO CICHLA REPRESENTAM IMPORTANTE IMPACTO À BACIA DO ALTO RIO PARANÁ ONDE FOI INTRODUZIDA, O QUE ORIGINOU A PRESENTE PROPOSTA DESSE ESTUDO. O OBJETIVO CENTRAL DESSE PROJETO FOI REALIZAR UMA ANÁLISE DO PROCESSO DE INTRODUÇÃO DA ESPÉCIE CICHLA MONOCULUS NO RESERVATÓRIO DE CAPIVARA, COMO FORMA DE AVALIAR BIOLOGICAMENTE SE A MESMA PODE SER CONSIDERADA COMO UMA INVASORA ―LATU SENSO‖. FORAM COMPILADOS DADOS DE CAPTURA DOS ANOS DE 1991 A 1999 (RELATIVOS AO PROJETO TIBAGI, TRECHO RESERVATÓRIO). E AS COLETAS RELATIVAS A ESTE ESTUDO FORAM REALIZADAS TRIMESTRALMENTE CORRESPONDENDO AO PERÍODO DE OUTONO DE 2001 A VERÃO DE 2002, OUTONO DE 2002 A VERÃO DE 2003 E OUTONO DE 2009 A VERÃO DE 2010 FINALIZANDO 3 CICLOS (I, II E III, RESPECTIVAMENTE). OS RESULTADOS NOS POSSIBILITARAM VERIFICAR QUE APÓS 3 ANOS DA PRIMEIRA INTRODUÇÃO DA ESPÉCIE (1997 A 1998), A MESMA JÁ ALCANÇOU PROPORÇÕES DE ABUNDANCIA EQUIVALENTE AS NATIVAS E COM ACRÉSCIMO POPULACIONAL SUBSEQÜENTE ATÉ 2003, COM FORTE INDICATIVO DE UM PROCESSO DE ESTABELECIMENTO E CONSEQÜENTE INVASÃO NO RESERVATÓRIO, COM MODESTA DEPLEÇÃO DURANTE O ULTIMO CICLO DE ESTUDO (CICLO III). OS DADOS DE DENSIDADE (CPUEN) DEMONSTRAM UMA TENDÊNCIA AO DECRÉSCIMO E O COMPRIMENTO PADRÃO MÉDIO NÃO APRESENTOU ALTERAÇÕES SIGNIFICATIVAS. A PROPORÇÃO SEXUAL APRESENTOU GRANDE VARIAÇÃO SENDO ATRIBUÍDA A FATORES AMBIENTAIS. FOI CAPTURADO UMA ELEVADA ABUNDANCIA DE INDIVÍDUOS JUVENIS (86,98% CICLO I; 81,81% CICLO II E 83,84% CICLO III), FATO QUE INDICA SUCESSO NO PROCESSO DE RECRUTAMENTO. ACIMA DE 55% DOS ESPÉCIMES COLETADOS ESTAVAM ENTRE A CLASSE DE TAMANHO DE 6 A 11 CM DE COMPRIMENTO PADRÃO. AS MÉDIAS DO FATOR DE CONDIÇÃO RELATIVO (KN) FORAM SEMELHANTES (PRÓXIMAS A 1,0) INDICANDO UM ALTO GRAU DE HIGIDEZ PARA A ESPÉCIE DURANTE TODO O PERÍODO DE ESTUDO. O PERÍODO REPRODUTIVO FOI LONGO SE ESTENDENDO POR TODA A ESTAÇÃO CHUVOSA (PRIMAVERA E VERÃO) COM REPRESENTATIVO DESTAQUE PARA A PRIMAVERA. UM PERÍODO EXTENSO DA ESTAÇÃO SECA (OUTONO E INVERNO) FOI REPRESENTATIVO CULMINANDO COM A NÃO DETECÇÃO DE INDIVÍDUOS EM ESTÁGIOS REPRODUTIVOS DURANTE A PRIMAVERA DE 2009. DIANTE DO SUCESSO E DA DISPERSÃO DA ESPÉCIE NO RESERVATÓRIO SE CONCLUI QUE A MESMA ENCONTRA-SE ESTABELECIDA E AMPLAMENTE DISTRIBUÍDA PELO RESERVATÓRIO