Linhas de Ação

A integração de informações de diferentes áreas como citogenética básica e molecular, mapeamento genético clássico, mapeamento de genes, seqüenciamento completo de genomas, microarrays, tem se tornado mais efetiva nos dias atuais, principalmente no que se refere ao esclarecimento da história evolutiva de grupos, assim como na elucidação de questões essenciais na biologia, como função gênica, determinação sexual e presença de cromossomos especializados como os cromossomos sexuais e cromossomos B.

A presente linha de pesquisa está focada na utilização de dois grupos animais como modelos: insetos e peixes. A característica mais marcante de peixes e insetos está na alta diversidade de espécies destes grupos quando comparados com grupos próximos, o que reflete numa ampla diversidade também nas suas constituições genômicas. Estes grupos mostram-se como modelos interessantes para identificar eventos genéticos e genômicos que levam à especiação e evolução. Dentro desta linha, os trabalhos desenvolvidos nos últimos anos pelo nosso grupo focam no (i) mapeamento físico cromossômico através de ferramentas citogenéticas (mapeamento de sequências cópia única presentes em BACs e sequências repetitivas), no sentido de entender a diversificação da estrutura cromossômica durante a história evolutiva dos grupos, e no (ii) estudo da dinâmica evolutiva da família multigênica de RNAr 5S. Mais recentemente, nosso foco tem sido direcionado ao (i) entendimento da determinação e diferenciação genética sexual em vertebrados basais utilizando genômica comparativa, no (ii) esclarecimento da origem e evolução dos cromossomos B, pela utilização de tecnologias integrativas entre citogenética, genômica, microarrays e bioinformática, e (iii) em estudos de genômica estrutural e funcional de microRNAs em peixes.

 

Conservação Biológica (encerrado!)

O conhecimento do genoma de populações e espécies é importante uma vez que fornece subsídios ao manejo das espécies quer seja visando sua exploração adequada ou conservação. Além disso, muitas espécies são importantes bioindicadores da qualidade ambiental e desempenham papel crucial na manutenção do ecossistema. Diversas espécies animais tem sido foco de interesse conservacionista, principalmente espécies de mamíferos e aves. Por outro lado, poucos estudos têm sido realizados em outros grupos de vertebrados e principalmente em invertebrados, quando comparado à extensa diversidade de espécies existentes. Dessa forma, o LGI vem direcionando esforços a estudos envolvendo dois modelos biológicos: (i) o tubarão-martelo (Sphyrna lewini), espécie cosmopolita que nas últimas décadas vem sofrendo acentuado declínio de suas populações em decorrência da exploração excessiva infligida pela pesca. A falta de dados em relação à dinâmica populacional e outros relativos à variabilidade genética dos estoques reprodutivos de S. lewini tem prejudicado a elaboração de estratégias para o manejo e conservação desta espécie. Baseado neste cenário, o LGI tem como objetivo avaliar a estrutura populacional de S. lewini na costa do Brasil através da utilização de microssatélites e fornecer subsídios para a criação de áreas prioritárias destinadas à preservação do pool genético desta espécie. (ii) besouros da família Scarabaeidae, grupo cosmopolita que possui aproximadamente 25.000 espécies descritas. São importantes recicladores da matéria orgânica em diversos ecossistemas tropicais além de serem bons bioindicadores da qualidade ambiental. Apesar da grande diversidade do grupo poucos estudos genéticos têm sido desenvolvidos no mesmo. Assim, o LGI está direcionando esforços ao conhecimento da diversidade genética do grupo utilizando marcadores citogenéticos e de seqüências de DNA.

Atividades de Extensão e Ensino (em andamento!)

       As atividades de pesquisa do Laboratório de “Genômica Integrativa” estão conectadas à formação de recursos humanos através do desenvolvimento de trabalhos de iniciação científica, conclusão de curso de graduação e  dissertações e teses de pós-graduação. Além disso, estudantes de graduação e pós-graduação são envolvidos na organização dos cursos de extensão “Manipulação de Ácidos Nucléicos: do DNA ao Produto Gênico” (realizado no mês de fevereiro) e “Introdução à Biologia Molecular” (realizado em julho) ministrados anualmente no IB. Durante os últimos anos estes cursos vêm contribuindo para a qualificação de centenas de profissionais e estudantes de diversas regiões do país.

       Além disso, o Laboratório “Genômica Integrativa” também participa do Projeto de Extensão “Difundindo e Popularizando a Ciência na UNESP: Interação entre Pós-Graduação e Ensino Básico”, que objetiva envolver professores/pesquisadores, pós-graduandos e graduandos do Instituto de Biociências da UNESP na difusão e popularização dos avanços recentes em Ciência e Tecnologia. O projeto atua basicamente em três frentes: (i) realização de atividades/cursos/oficinas direcionadas a professores e alunos do ensino médio; (ii) produção de material inovador para o ensino; e (iii) programa Jovens Cientistas que possibilita estudantes do ensino médio desenvolver trabalhos de iniciação científica junto a laboratórios do IB.