Os protozoários são seres constituídos por uma única célula, não produzem seu próprio alimento, razão de serem denominados de heterótrofos, são muito delicados, visto que não possuem parede celular, e só podem ser observados ao microscópio, uma vez que são extremamente pequenos. Quando os protozoários são capazes de se alimentar e se reproduzir recebe o nome de trofozoítos . Em determinadas situações adversas eles se transformam no que ficou conhecido como cisto , ao secretar uma parede ao redor de si, a parede cística. Essa estrutura confere proteção quando o ambientes está impróprio, isto é, nos quais o desenvolvimento do protozoário pode ser prejudicado. Por isso, o cisto é conhecido como a forma resistente do protozoário.

A maioria das espécies desse grupo é aquática de vida livre. No entanto, há espécies que se associam a outros seres vivos estabelecendo relações de interdependência mais estreitas.